Phos-tag SDS-PAGE データ集 differential 2D
toppage

Histone H3

Core component of nucleosome. Mw; 15,400

keratin8 / keratin18

Keratins are intermedeate filament protein that are mainly expressed in epithelial cells.
Mw; keratin8=53,000, keratin18=47,000

vimentin

Vimentins are class-III intermediate filaments found in various non-epithelial cells, especially mesenchymal cells. Vimentin is attached to the nucleus, endoplasmic reticulum, and mitochondria, either laterally or terminally.
Mw; 54,000

laminA/C

Lamins are components of the nuclear lamina, a fibrous layer on the nucleoplasmic side of the inner nuclear membrane, which is thought to provide a framework for the nuclear envelope and may also interact with chromatin. Lamin A and C are present in equal amounts in the lamina of mammals. Plays an important role in nuclear assembly, chromatin organization, nuclear membrane and telomere dynamics.
Mw; laminA=74,000, laminC=65,000

elongation factor 2

Threonine kinase that regulates protein synthesis by controlling the rate of peptide chain elongation
Mw; 95,000

泳動結果

differential 2D

HeLa 細胞において,Ser/Thr phosphatase 阻害剤のcalyclinA処理前後の
細胞内タンパク質のリン酸化状態nの違いを,
蛍光二次元ディファレンシャル電気泳動
(SDS-PAGE/Zn2+–Phos-tag SDS-PAGE)で調べています。

calyclinA処理によって,細胞内タンパク質の多くがハイパーリン酸化します。
この時の細胞タンパク質をCy5(緑色)で標識します。

一方,何も処理しない場合の細胞タンパク質をCy3(ピンク色)で標識します。

両者を混合し,SDS-PAGE を行います。
そのゲルのレーンを切り取り,二次元目のZn2+–Phos-tag SDS-PAGEを行います。

両サンプルに含まれるタンパク質で,同じ位置に泳動されるものは
重なって白色に見えます。

リン酸化していないタンパク質は,概ねゲルの対角線上に並びます。
ただし,リン酸化にかかわらず,Phos-tagとタンパク質の相互作用があり
それはタンパク質ごとに異なるので,完全に対角線上には乗りません。

リン酸化しているタンパク質のスポットは,
その対角線から外れてシフトアップします。

ここで,とりわけ興味深いのが,図中に1〜6の番号で指したタンパク質です。
calyclinA処理によって,緑のスポットが上方に複数シフトアップしています。

ゲルからスポットを切り抜き,質量分析で解析したところ,
1= histone H3
2 = keratin18
3= keratin 8
4= vimentin
5=laminA/C
6=elongation factor 2
とわかりました。

 


 

Reference

Kinoshita, E., Kinoshita-Kikuta, E., Koike, T.
Phos-tag SDS-PAGE systems for phosphorylation profiling of proteins with a wide range of molecular masses under neutral pH conditions Proteomics, 12, 192-202 (2012)

 10.1002/pmic.201100524

ゲルの条件

Zn2+–Phos-tag: 50µM

Polyacrylamide: 5.5-8.0%(w/v)

検出方法  image scanner:

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